1、模式不同：USB-FDD是模拟软盘模式；而USB-HDD是硬盘仿真模式。

2、兼容性不同：USB-FDD以前的机子没有光驱，也不支持USB-HDD。而USB-HDD此模式兼容性很高，但对于一些只支持USB-ZIP模式的电脑则无法启动。

3、启动盘符不同：USB-FDD模式会在命令行上显示盘符是A。而USB-HDD启动U盘后的盘符是C。