广州铁路局的部门有：
职能机构：办公室（董事会办公室）、企业管理和法律事务部、科技和信息化部（总工程师室）、运输部、客运部、货运部、机务部、车辆部、工务部、电务部、供电部、*监察室（铁路**管理办公室）、设备监造部、计划统计部、财务部（收入部）、人事部、劳动和卫生部、审计部、建设部、物资部、经营开发部、职工培训部、土地房产部、保卫部（人民武装部）、社会保险部、离退休管理部、对外合作部。
附属机构：机辆*所、工电*所、客票管理所、统计所、机要通信室（保密室）、档案史志室、法律服务所、*监察大队（长沙、怀化、惠州、肇庆、海口、广州、衡阳、张家界、娄底）、收入稽核大队、资金结算所（财务集中核算管理所）、人才交流培训站、职业技能鉴定指导站（劳动力调剂站）、审计室（广州、长沙）、铁路客户服务中心、货运受理服务中心、工程质量*站、概预算审查所、卫生*所（广州、长沙、海口）、物资设备采购供应所、房产管理所（土地管理办公室）（广州、长沙）、反恐办公室（武器库）、合资铁路管理办公室、护路联防办公室、广州社会保险管理办公室、活动室、防洪指挥部办公室（绿化办）、资产运营*所。