新车上牌后合格证是要交给车管所保管的。车辆合格证是：

1、车辆的另一个重要证明，也是车辆在使用时所必需的证件；

2、只有合格证的车辆才能满足*对机动车设备质量及相关标准的要求；

3、车辆上牌照都是需要车辆合格证才能办理的，没有合格证的车辆无法上路行驶。